奶牛業所涉及的大多數性狀是限性性狀。然而，對產奶量遺傳進展的一半是由于選擇幼年公畜帶來的。一頭公牛的產奶性狀的育種值必須從有關母牛計算出來。現在可以準確地評定一頭公牛的真正遺傳品質，但此過程世代間隔長，母牛群體相對較大。遺傳標記不受動物性別、年齡或發育階段的限制。

一旦一種標記與一個數量性狀位點之間的關系被確定，那么這種標記輔助選擇計劃就可以在公牛和母牛上得以實現。繁殖和健康等性狀的重要性日益增加，這些性狀的遺傳力通常較低，受環境影響較大。分子標記不受環境因子的影響，因此它可以回答迄今為止未知的問題。全球多所大學和研究中心三十多年的實驗研究及牧場的實踐經驗均表明，美加力是市面上經得起檢驗的飼料原料。能量密度是谷類的

2.5倍以上，能改善泌乳奶牛的能量損失，增強體況，增加成功受孕機會。泌乳凈能高達6.52Mcal/kg DM,是目前檢測過原料中Z高的，能提升飼料的利用率，增加牛奶產量。

對不理想的單基因性狀，抗病力以及對疾病易感性的標記日益增多。此外，分子技術也能發展于嵌合體的研究，例如，一種DNA測試目前能有效的早期識別異性雙胎不育母犢牛。但試圖應用DNA技術于非生產性狀的主要限制因素是缺乏信息和保存系統記錄。在進入性能和后裔測定前，幼預選畜，特別是對那些具有類似或一致譜系的動物應用遺傳標記具有誘人的前景。應用已證實了的遺傳標記在生命的早期預選公牛或母犢牛，并可補充完整的記錄，淘汰那些缺乏有利標記的動物，將會提高所留動物的平均遺傳值。

早期選種帶來選種效率的提高在養牛業中具有深遠的意義。遺傳多態性提供了直接探測遺傳變異增加選擇準確性的機會，可補充已建立起的常規選種技術程序，但一般認為還不能代替傳統的選擇方法。